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企业申请双软认证能得到以下优惠政策：
企业申请双软认证介绍软件产品登记享受税收、工资培训费抵扣这两项优惠政策。软件企业享受"两免三减半"政策。
1、企业申请双软认证增值税优惠：增值税一般纳税人销售其自行开发生产的软件产品，按17%税率征收增值税后，对其增值税实际税负超过3%的部分实行即征即退政策。所退税款由企业用于研究开发软件产品和扩大再生产，不作为企业所得税应税收入，不予征收企业所得税。
2、企业的工资和培训费用抵扣：经认定的软件生产企业的工资和培训费用，可按实际发生额在计算应纳税所得额时扣除。
3、"两免三减半"政策：对我国境内新办软件生产企业经认定后，自开始获利年度起，第一年和第二年免征企业所得税，第三年至第五年减半征收企业所得税。
4、知识产权的保护。软件版权受到侵权时，对于软件著作权登记证书司法机关可不必经过审查，直接作为有力证据使用；此外也是国家著作权管理机关惩处侵犯软件版权行为的执法依据。
5、作为技术出资入股的依据。 《关于以高新技术成果出资入股若干问题的规定》规定："计算机软件可以作为高新技术出资入股，而且作价的比例可以突破公司法20%的限制达到35%"
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